GMP車間要消毒滅菌，可采用干熱滅菌、濕熱滅菌、輻射滅菌、氣體滅菌(臭氧）、消毒劑消毒。

  現介紹輻射滅菌（紫外線），主要適用于熱敏性物質或產品的滅菌，但必須證明該射線對產品無害。紫外線輻射消毒具有一定的殺菌效力，但在使用中存在不少問題，

1.紫外線燈管的強度、潔凈度、環境濕度和距離等諸多因素都會影響消毒效果。

2。其消毒效果不高，不適用于有人員活動的空間和有氣流流動的空間，這些原因使紫外線消毒不被國外GMP接受。

3.滅菌半徑小，紫外線滅菌對暴露對象需長時間照射，對于室內輻照，當要求滅菌率達到99%時，一般細菌的照射劑量約為10000-30000uw.S/cm。一支距地面2m的15W的紫外燈，其照射強度約為8uw/cm，則需照射1h左右才行，而在這1h之內被照射場所不能進入，否則對人的皮膚細胞也有損壞，有明顯的致癌的作用。

4.輻射滅菌是通過光源照射，進而破壞DNA和RNA，但有時，細菌經過一段時間可以自行修復，因細胞整體未被破壞。

5.紫外滅菌 因其是照射，所以會存在大量死角，未被照射到或超出距離，都不能達到殺滅功能

  臭氧氣體滅菌，臭氧是一種非常強的氧化氣體，現廣泛應用于GMP車間的消毒，也是國家GMP車間認證的一部分

1.臭氧消毒殺菌，是一種強氧化作用，對所有病毒和細菌都有效果，因為臭氧通過強氧化性可以快速氧化細胞壁，可使細胞壁溶解破裂，內部位置外流，氧化細胞質,DNA和RNA，所以臭氧消毒是破壞性的，病毒和細菌無法進行自我修復。

2.臭氧是一種略重于空氣的氣體，因氣體具有擴散性，所以不存在死角為題，在濃度達到10PPM以上時，只需5分鐘就可以殺滅大部分種類的細菌和病毒。

3.投加方式簡單，可控，可通過中央空調投加，換風系統投加，壁掛式投加，移動式投加等多種方式。